Las líneas de trabajo seguidas por Junta Islámica se han caracterizado por impulsar el desarrollo de la libertad de conciencia y propiciar espacios comunes de encuentro e intercambio sobre temas de interés social, económico, cultural y religioso.
Desde hace más de 30 años Junta Islámica trabaja en el desarrollo de diversos proyectos sobre el islam, fomentando valores democráticos y de convivencia entre diferentes colectivos en un espacio aconfesional, desde el respeto, la educación y el conocimiento mutuo.
Nuestra organización está abierta a todas las personas, entidades e instituciones de la sociedad que les pueda interesar nuestro trabajo y nuestros planteamientos. Trabajamos desde la plena libertad de conciencia, la espiritualidad consciente y sincera y los valores del Corán y la Sunna.
Junta Islámica coopera de forma activa por los derechos de la ciudadanía musulmana con el Gobierno de España, la Junta de Andalucía, el Ayuntamiento de Córdoba, la Universidad de Córdoba (UCO) y la Universidad Internacional de Andalucía (UNIA), Universidad de Extramadura (UEX), Universidad de Zaragoza, la fundación Tres Culturas del Mediterráneo, y Casa Árabe con la cual desarrolla el programa de Noches de Ramadán.
Tenemos diferentes actividades como asistencia religiosa, desarrollos de ciudadanía musulmana y actividades culturales y de divulgación del islam. También tenemos proyectos como son Instituto Halal, la Fundación las Fuentes, Verislam.com o la Federación FECIM.